In de oudheid lag de belangrijkste rituele betekenis van de mandrake in erotische culten. Vanwege de slechte kwaliteit van de bronnen die tot ons zijn gekomen, is echter slechts rudimentaire informatie over deze praktijken beschikbaar. De belangrijkste bron over het gebruik van mandrake in het Oosten is het Oude Testament, waar de vruchten (liefdesappels) vele malen genoemd worden onder de Oudhebreeuwse naam duda'im, en namelijk als afrodisiacum (niet alle bijbeluitleggers erkennen de identificatie van duda'im met Mandragora). Volgens Rabbi Jacob ben Asher (1269-1343) heeft de naam duda'im zijn basis in de numerologie. De numerieke waarde van het woord is identiek aan die van het Hebreeuwse woord ke'adam, 'als een mens', en is een toespeling op de antropomorfe vorm. Het is mogelijk dat de mandrake, die volgens kabbalistische principes een symbool is om er een te worden, gebruikt is in geheime mystieke riten in het oude Israël.

De lustopwekkende kwaliteit werd voornamelijk toegeschreven aan de geur van de rijpe, goudgele vruchten. Het boek Genesis bevat een verslag van wat een archaïsch magisch ritueel kan zijn geweest:
En Ruben ging in de dagen van de tarweoogst [mei], en vond mandrakes [duda'im] in het veld, en bracht ze naar zijn moeder Lea. Toen zei Rachel tegen Lea [haar zus]: Geef mij toch de mandrakes van uw zoon. En ze zei tegen haar: Is het een kleine zaak dat je mijn man hebt meegenomen? en zoudt gij ook de mandrakes van mijn zoon willen wegnemen? En Rachel zei: Daarom zal hij vannacht bij u liggen voor de mandrakes van uw zoon. En Jakob kwam 's avonds uit het veld, en Lea ging hem tegemoet en zei: Je moet bij mij binnenkomen; want ik heb u zeker gehuurd met de mandrakes van mijn zoon. En hij lag die nacht bij haar. En God luisterde naar Lea, en zij werd zwanger en baarde Jakob de vijfde zoon. (Genesis 30:14-17)

Een soortgelijk ritueel met de magische vrucht blijkt de basis te zijn van de veel geciteerde tekst van het erotische Hooglied:
"Daar zal ik je mijn liefdes geven, de mandrakes geven een geur."
(Hooglied 7:12, 13)

In het Nabije Oosten worden de aromatische vruchten van de mandrake nog steeds beschouwd als afrodisiaca en gebruikt in liefdesmagie.
In een andere legende uit de postbijbelse periode wordt de schepping van de mandrake toegeschreven aan Adam zelf:
Toen Adam voor een lange periode van zijn vrouw Eva was gescheiden, speelde de lange onthouding hem parten. Hij fantaseerde met zo'n ijver over haar aanwezigheid dat uit zijn zaad, dat door de liefdevolle omhelzing naar buiten schoot en op de vloer spoot, een plant ontstond die een menselijke vorm aannam, de Caiumamth, de mandragora.

De meest uitgebreide beschrijving van deze magische en erotische wortel en het ritueel rond de oogst is van Flavius Josephus (eerste eeuw), die in het Grieks schreef om de gebruiken van het volk van Judea begrijpelijker te maken voor de Grieken. Het is mogelijk dat hij zijn magische en botanische kennis verkreeg van de Essenen, met wie hij enige tijd samenleefde:
In de vallei die aan de noordkant van de stad Machairos ligt, is een speciale plaats bekend als Baaras, waar een wortel met dezelfde naam groeit. Elke avond schittert het met een vuurrode gloed. Maar als iemand het wil benaderen om het eruit te trekken, dan is het moeilijk vast te pakken, het trekt weg van de handen en kan niet worden vastgehouden totdat men er menstruatiebloed of urine op heeft gegoten.
Maar zelfs dan betekent elk direct contact met de wortel een plotselinge dood, tenzij men hem in de hand draagt zodat de punt van de wortel naar beneden wijst. Alleen kan men de wortel ook zonder gevaar in bezit nemen op de volgende manier: Je graaft de aarde rondom op, zodat slechts een klein stukje van de wortel bedekt blijft met de grond. Dan wordt er een hond aan vastgebonden. Wanneer deze de persoon probeert te volgen die hem heeft vastgebonden, zal hij natuurlijk vrij gemakkelijk de wortel uit de grond trekken. Maar op dat moment zal de hond sterven, als om te boeten voor degene die de plant werkelijk heeft weggenomen. Vanaf dat moment kan men de wortel zonder angst vastgrijpen. De reden dat deze wortel ondanks zijn gevaarlijke aard zo gewild is, is te vinden in zijn eigenaardige effecten: want hij heeft de macht om de zogenaamde demonen te verdrijven, dat wil zeggen de geesten van kwaadaardige overledenen die in de levende wezens komen. en dood ze als ze niet geholpen worden, gewoon door in de buurt van de getroffenen te komen. (Flavius Losphus, Geschiedenis van de Judese Oorlog)

In het oude Egypte werden mandrake-vruchten gebruikt als liefdesgeschenk tijdens de verkering en waarschijnlijk als afrodisiaca. De liefdesplant lijkt te zijn geassocieerd met Hathor, de godin van de liefde. Het aan haar gewijde mandrakebier speelde een belangrijke rol in de beroemde mythe die de vernietiging van de mensheid en de schepping van de hemel beschrijft. De zonnegod Ra was boos op mensen omdat ze hem hadden willen aanvallen. In zijn woede creëerde hij de verschrikkelijke godin Sekmet met een leeuwenkop (een vroege vorm van Hathor) om het mensenras te straffen. Ze woedde een hele dag onder de mensen en was nog niet klaar toen de zon onderging, want ze wilde de mensheid volkomen uitroeien. Maar Ra wilde dit niet en hij bedacht een truc om een einde te maken aan de dodelijke razernij van de godin. Hij liet mandrakevruchten brengen van Elephantine, een eiland in de Nijl. Volgens andere versies en/of vertalingen werd ook hematiet of “rode oker” meegebracht. Tegelijkertijd gaf hij opdracht tot de productie van een enorme hoeveelheid gerstebier (zevenduizend kannen). Hij mengde de mandrakes (en de hematiet of rode oker) hierin en liet de velden bedekken met het bloedrode bier (de “slaapdrank”). De volgende zonsopgang, toen de godin het bier zag, zag ze voor het eerst haar spiegelbeeld en herkende ze zichzelf. Vanwege de rode kleur dacht ze dat het bier mensenbloed was en dronk ze het gretig op tot de laatste druppel. “Haar gelaat werd daardoor zacht en ze dronk; dit deed haar goed aan het hart. Dronken keerde ze terug, zonder de mensen te hebben herkend”.
Uit dankbaarheid kwamen mensen nooit meer in opstand tegen Ra. Sakmet veranderde zichzelf in de koe Hathor en droeg Ra de hemel in. Ter herdenking van deze dramatische gebeurtenissen, die plaatsvonden in het begin der tijden, richtte Ra het Hathor-festival in (letterlijk, "feest van dronkenschap"), waarbij jonge meisjes aan de godin een bier zou maken dat bekend staat als sdr.t ("slaapdrank") met een soortgelijk recept. De Hathor-festivals waren extatische orgieën met obscene optredens, offeractiviteiten en wilde muziek. Later werd Hathor gevierd als de uitvinder van bier en de "meesteres van de dronkenschap zonder einde".

De mandrake was ook een heilige liefdesmagie in het oude Griekenland. Zelfs het oogsten van de plant vond plaats onder auspiciën van de liefdesgodin: “Men zou, zo wordt gezegd, met een zwaard drie cirkels rond de mandrake moeten maken en deze doorsnijden terwijl je naar het westen kijkt. En bij het snijden van het tweede stuk moet men rond de plant dansen en zoveel mogelijk praten over de mysteries van de liefde”.
De Cypriotische cultus van Aphrodite is rechtstreeks voortgekomen uit de oosterse cultus van de liefdesgodin Ishtar, Astarte, Asherot, enzovoort. J. Rendel Harris stelde de theorie voor dat de Griekse cultus van Aphrodite terug te voeren is op de Griekse assimilatie van de oosterse opvattingen over de mandrake. Aphrodite was ook bekend als Mandragoritis ("zij van de Mandragora"), een naam die door Heschius aan ons werd doorgegeven. De Mandragora had dus een intieme band met de liefdesgodin en was haar heilig (vgl. Papaver somniferum). In de laat-oude Mysteriën van de Grote Godin werd Aphrodite geïdentificeerd met Hecate (Apuleius, Metamorphoses). Dus de "mandrake van Hecate" was niets anders dan de heilige plant van de liefdesgodin.
De mandrake, en vooral de wortel, was de plant van Hecate.

De chtonische godin (ook bekend als Enodia of Trivia) kwam uit Kairen (Klein-Azië) en droeg veel Aziatische attributen. Als de godin van de drie paden,  had ze drie vormen,  drie hoofden en zes armen. Ze was tegelijkertijd geworteld in de hemel, op aarde en in de onderwereld. Als godin van de nachtelijke spoken (visuele hallucinaties) werd ze in haar wilde activiteiten vergezeld door blaffende honden en luidruchtige spoken (auditieve hallucinaties). Hecate was zowel de schadelijke heksengodin (gifvoedsel) als de godin van de geboorte (afrodisiaca, erotische hallucinaties). Een beschrijving van de magische tuin van Hecate is te vinden in de sage van de Argonauten: "Veel mandrakes groeien binnenin".

Eusebios (ca. 260-339 CE), de christelijke en Griekse kerkauteur, beschouwde Hecate, de godin van de onderwereld, als de 'heerser van alle boze demonen', de 'zwarte' of een 'demon van liefdeswaanzin' ' dat was het equivalent van Aphrodite. Ze is de moeder van de Italiaanse Circe en Colchis' Medea, de "kosmische superheks". Ze stuurt mensen dempende slaap en zware dromen en veroorzaakt epilepsie (de "heilige ziekte") en waanzin (manie); met andere woorden, ze is in staat om veranderde bewustzijnstoestanden teweeg te brengen. Het lijkt bijna alsof de duistere godin zich alleen zou openbaren door de effecten van het mandrake-sap. Zoals Democritus (ca. 470-380 vGT), de 'lachende filosoof', beschreef in zijn verloren gegane werk Cheirokmeta ("dingen gemaakt met de hand"), zou men de godin kunnen aanroepen met de mandrake:
Nu is bekend dat het boek Cheirokmeta van Democritus is. En hoeveel avontuurlijke dingen kan deze man vertellen, die na Pythagoras de meest toegewijde leerling van magie was! Hij bericht over de plant aglaophotis, die zijn naam kreeg vanwege het wonder van de mens vanwege zijn speciale kleur, en die gedijt in de marmergroeven van Arabië aan de Perzische kant, daarom wordt hij ook tnarmaritis [= marmerplant] genoemd; de tovenaars gebruiken het wanneer ze de goden willen aanroepen.

Veel laatoude bezweringen (magische papyri) doen een beroep op Hecate als de belangrijkste godin. Ze werd meestal aangeroepen in liefdesmagie, en dan vaak in samenwerking met honden, en zelfs met Cerberus. In de magische papyri werd Medea soms aangeroepen in plaats van Hecate.

De mandrake was ook de plant van Circe. De dochter van Helios, ze was goed geïnformeerd over magie en woonde aan de Italiaanse kust boven Sicilië. Tegenwoordig blijft Monte Cicero de heilige berg van Circe.
Het is mogelijk dat de mandrake al in een vroeg stadium met moly werd geïdentificeerd.

Over het rituele gebruik van mandrake in Germanië kunnen we alleen maar speculeren. De mandrake werd blijkbaar voornamelijk geassocieerd met liefdesmagie en waarzeggerij, maar ook met magische en rituele genezing. Hildegard von Bingen beschreef een klein ritueel om de psyche te beïnvloeden (een soort rituele genezing van depressie):
En wanneer een persoon zo verward is van aard dat hij altijd verdrietig en altijd in nood is, zodat hij vaak zwakte en pijn in zijn hart heeft, moet hij mandrake nemen nadat deze al met zijn wortel uit de grond is getrokken, en hij zou hem een dag en een nacht in een bron moeten plaatsen... en hem dan, gewassen door de bron, naast hem in zijn bed moeten leggen. De plant zal warm worden van zijn zweet en hij zou moeten zeggen: "God, die zonder pijn mensen maakt uit het vuil van de aarde. Nu leg ik deze aarde, waar nog nooit overheen is gestapt, naast mij, zodat ook mijn aarde die vrede zal voelen die jij hebt geschapen.”

In de magie van de Renaissance en in het vroegmoderne occultisme werd mandrake gebruikt als wierook onder invloed van de maan. In Mecklenburg werden vroeger mandrakes onder het kussen gelegd zodat men profetische dromen zou hebben.
In Roemenië bestond tot in het begin van de twintigste eeuw een erotische mandrakecultus (Eliade 1942). In deze cultus werd de mandrake beschouwd als de plant van leven en dood en werd gezien als een afrodisiacum en magische liefdesagent. De plant werd geoogst tijdens de volle maan tussen Pasen en Hemelvaartsdag. De oogst werd uitgevoerd volgens rituele richtlijnen:
De plant moet worden verzameld zonder dat anderen het weten;
 . . . vrouwen en meisjes dansen naakt rond de mandrake, soms zijn ze tevreden met het gewoon los laten van hun haar. De koppels strelen en omhelzen elkaar. Om de bladeren van de mandrake te verzamelen, liggen de meisjes op elkaar op de manier van de seksuele daad. Vier jonge meisjes plukken de mandrake en spreken er magische formules over uit; ze begraven het midden op straat, waar ze vervolgens helemaal naakt dansen. Tijdens de dans blijven vier jonge jongens in de buurt om over hen te waken; ze herhalen:

"Mandrake, goede moeder,
trouw met me in deze maand,
zo niet in deze, dan in de volgende,
maar zorg ervoor dat ik niet langer een meisje blijf.”

Offers (zout, brood, suiker, wijn, alcohol, eieren, enzovoort) werden in het gat gedaan waaruit de mandrake was genomen. De wortel werd naar huis gedragen, zorgvuldig gewassen en als talisman gedragen.